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The Sequence Manipulation Suite Copyright © 2000, 2004 Paul Stothard. Send questions and comments to stothard@ualberta.ca
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- SMS2南京德泰生物镜像
酶切突变工具可以在目标序列中查找与特定酶切位点最为相似的片段,并进行定点突变。此工具会展示翻译后的蛋白质序列信息,以便于查看哪一种开放阅读框被该突变修改了。酶切突变工具可以为PCR或者定点突变选择最小代价即可获取限制性酶切位点的序列位置。
输入原始序列或1至多条FASTA格式序列,长度限定在10000以内。
>CDS1 atgtctgattcgctaaatcatccatcgagttctacggtgcatgcagatgatggattcgag ccaccaacatctccggaagacaacaacaaaaaaccgtctttagaacaaattaaacaggaa agagaagcgttgtttacggatctattcgcagatcgtcgacgaagcgctcgttctgtgatt gaagaagctttccaaaacgaactcatgagtgctgaaccagtccagccaaacgtgccgaat ccacattcgattcccattcgtttccgtcatcaaccagttgctggacctgctcatgatgtt ttcggagacgcggtgcattcaatttttcaaaaaataatgtccagaggagtgaacgcggat tatagtcattggatgtcatattggatcgcgttgggaatcgacaaaaaaacacaaatgaac tatcatatgaaaccgttttgcaaagatacttatgcaactgaaggctccttagaagcgaaa caaacatttactgataaaatcaggtcagctgttgaggaaattatctggaagtccgctgaa tattgtgatattcttagcgagaagtggacaggaattcatgtgtcggccgaccaactgaaa ggtcaaagaaataagcaagaagatcgttttgtggcttatccaaatggacaatacatgaat cgtggacagagtgacatttcacttcttgcggtgttcgatgggcatggcggacacgagtgc tctcaatatgcagctgctcatttctgggaagcatggtccgatgctcaacatcatcattca caagatatgaaacttgacgaactcctagaaaaggctctagaaacattggacgaaagaatg acagtcagaagtgttcgagaatcttggaaaggtggaaccactgctgtctgctgtgctgtt gatttgaacactaatcaaatcgcatttgcctggcttggagattcaccaggttacatcatg tcaaacttggagttccgcaaattcactactgaacactccccgtctgacccggaggaatgt cgacgagtcgaagaagtcggtggccagatttttgtgatcggtggtgagctccgtgtgaat ggagtactcaacctgacgcgagcactaggagacgtacctggaagaccaatgatatccaac aaacctgataccttactgaagacgatcgaacctgcggattatcttgttttgttggcctgt gacgggatttctgacgtcttcaacactagtgatttgtacaatttggttcaggcttttgtc aatgaatatgacgtagaagattatcacgaacttgcacgctacatttgcaatcaagcagtt tcagctggaagtgctgacaatgtgacagtagttataggtttcctccgtccaccagaagac gtttggcgtgtaatgaaaacagactcggatgatgaagagagcgagctcgaggaagaagat gacaatgaatag
使用此工具之前,请详细了解
浏览器兼容性
要求.
目标酶切位点
AatI agg|cct
AatII gacgt|c
Acc16I tgc|gca
AccII cg|cg
AccIII t|ccgga
AclI aa|cgtt
AcvI cac|gtg
AfaI gt|ac
AfeI agc|gct
AflII c|ttaag
AgeI a|ccggt
AhlI a|ctagt
Alw441 g|tgcac
AluI ag|ct
Aor51HI agc|gct
ApaI gggcc|c
ApaLI g|tgcac
AscI gg|cgcgcc
AseI at|taat
Asp718I g|gtacc
AsuII tt|cgaa
AvaI c|ycgrg
AviII tgc|gca
AvrII c|ctagg
BalI tgg|cca
BamHI g|gatcc
BanIII at|cgat
BbeI ggcgc|c
BbrPI cac|gtg
BbuI gcatg|c
BcuI a|ctagt
BclI t|gatca
BfaI c|tag
BfrI c|ttaag
BfrBI atg|cat
BglII a|gatct
BlnI c|ctagg
BseCI at|cgat
BsePI g|cgcgc
BseX3I c|ggccg
BshTI a|ccggt
Bsp1407I t|gtaca
Bsp19I c|catgg
BspDI at|cgat
BspEI t|ccgga
BsrGI t|gtaca
BssHII g|cgcgc
BstUI cg|cg
ClaI at|cgat
DraI ttt|aaa
EagI c|ggccg
EcoRI g|aattc
EcoRV gat|atc
EgeI ggc|gcc
FseI ggccgg|cc
FspI tgc|gca
HaeIII gg|cc
HincII gty|rac
HindIII a|agctt
HinfI g|antc
HpaI gtt|aac
HpaII c|cgg
KasI g|gcgcc
KpnI ggtac|c
MboI |gatc
MfeI c|aattg
MluI a|cgcgt
MscI tgg|cca
MseI t|taa
MspI c|cgg
NaeI gcc|ggc
NarI gg|cgcc
NcoI c|catgg
NdeI ca|tatg
NdeII |gatc
NgoMIV g|ccggc
NheI g|ctagc
NotI gc|ggccgc
NruI tcg|cga
NsiI atgca|t
PacI ttaat|taa
PciI a|catgt
PhoI gg|cc
PmeI gttt|aaac
PmlI cac|gtg
PsiI tta|taa
PstI ctgca|g
PvuI cgat|cg
PvuII cag|ctg
RsaI gt|ac
SacI gagct|c
SacII ccgc|gg
SalI g|tcgac
SbfI cctgca|gg
ScaI agt|act
SfoI ggc|gcc
SmaI ccc|ggg
SnaBI tac|gta
SpeI a|ctagt
SphI gcatg|c
SspI aat|att
SstI gagct|c
SstII ccgc|gg
StuI agg|cct
SwaI attt|aaat
TaqI t|cga
TliI c|tcgag
VspI at|taat
XbaI t|ctaga
XhoI c|tcgag
XmaI c|ccggg
sites.
每行展示
105
90
75
60
45
30
个碱基
为开放阅读框
1
2
3
1, 2, and 3
大写
none
展示翻译信息
使用
standard (1)
vertebrate mitochondrial (2)
yeast mitochondrial (3)
mold mitochondrial (4)
invertebrate mitochondrial (5)
ciliate nuclear (6)
echinoderm mitochondrial (9)
euplotid nuclear (10)
bacterial (11)
alternative yeast nuclear (12)
ascidian mitochondrial (13)
flatworm mitochondrial (14)
Blepharisma macronuclear (15)
chlorophycean mitochondrial (16)
trematode mitochondrial (21)
Scenedesmus obliquus mitochondrial (22)
Thraustochytrium mitochondrial (23)
密码子表
.
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引用文献
Thu Aug 27 17:17:36 2015