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The Sequence Manipulation Suite Copyright © 2000, 2004 Paul Stothard. Send questions and comments to stothard@ualberta.ca
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蛋白亲水性分析工具
- SMS2南京德泰生物镜像
蛋白亲水性分析工具的算法来自于文献
Kyte and Doolittle; 1982
。该工具会根据统计数据为每一个氨基酸分配一个亲水值,整个序列的亲水值=所有氨基酸的亲水值除以总氨基酸数。
输入原始序列或1到多条FASTA序列,长度限制在500000以内。
>sample sequence 1 MQKSPLEKASFISKLFFSWTTPILRKGYRHHLELSDIYQAPSADSADHLSEKLEREWDREQASKKNPQLIHALRRCFFWRFLFYGILLYLGEVTKAVQPVLLGRIIASYDPENKVERSIAIYLGIGLCLLFIVRTLLLHPAIFGLHRIGMQMRTAMFSLIYKKTLKLSSRVLDKISIGQLVSLLSNNLNKFDEGLALAHFIWIAPLQVTLLMGLLWDLLQFSAFCGLGLLIILVIFQAILGKMMVKYRDQRAAKINERLVIT >sample sequence 2 SEIIDNIYSVKAYCWESAMEKMIENLREVELKMTRKAAYMRFFTSSAFFFSGFFVVFLSVLPYTVINGIVLRKIFTTISFCIVLRMSVTRQFPTAVQIWYDSFGMIRKIQDFLQKQEYKVLEYNLMTTGI >sample sequence 3 IMENVTAFWEEGFGELLQKAQQSNGDRKHSSDENNVSFSHLCLVGNPVLKNINLNIEKGEMLAITGSTGLGKTSLLMLILGELEASEGIIKHSGRVSFCSQFSWIMPGTIKENIIFGVSYDEYRYKSV
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引用文献
Thu Aug 27 17:17:36 2015